21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4348 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4348  VIRB2 type IV secretion  100 
 
 		 99 aa  190  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5088  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  70 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0257  Type IV secretory pathway AvhB2 protein  64.95 
 
 		 98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0675  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  56.12 
 
 		 99 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4179  VIRB2 type IV secretion  46.25 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5009  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  41.58 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0925105  normal  0.161179 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3821  VIRB2 type IV secretion  38.27 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.454971  normal  0.0306094 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9268  conjugal transfer protein TrbC  39.39 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3639  conjugal transfer protein TrbC  38.27 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.22412 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3974  conjugal transfer protein TrbC  38.27 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6407  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  40.86 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9822  type IV secrection system pilin protein  50 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4564  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  40.54 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8226  type IV secretion system pilin subunit VirB2  36.47 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6161  type IV secretion system pilin subunit VirB2  36.9 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141107  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0169  hypothetical protein  30.59 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  39.77 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0151  hypothetical protein  30.38 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4447  conjugal transfer protein, trbC  38.27 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633969  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5374  conjugal transfer protein TrbC  34.18 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>