48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0643 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0643  imelysin  100 
 
 
417 aa  848    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  66.24 
 
 
425 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  67.51 
 
 
426 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  64.57 
 
 
424 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  64.07 
 
 
424 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  63.34 
 
 
441 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  63.09 
 
 
422 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  57.01 
 
 
431 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  60.1 
 
 
420 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  62.09 
 
 
422 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  61.73 
 
 
422 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  59.19 
 
 
420 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  53.38 
 
 
428 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  51.44 
 
 
431 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  53.23 
 
 
441 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  53.48 
 
 
445 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  53.21 
 
 
445 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  53.61 
 
 
448 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  52.96 
 
 
444 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  52.96 
 
 
443 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  51.28 
 
 
446 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  51.66 
 
 
475 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  52.67 
 
 
452 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  53.47 
 
 
445 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  50.39 
 
 
420 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  50.65 
 
 
423 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  52.14 
 
 
458 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  50.63 
 
 
417 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  48.89 
 
 
435 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  42.34 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  41.39 
 
 
480 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  47.62 
 
 
486 aa  270  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  40.89 
 
 
428 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  41.99 
 
 
399 aa  247  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  38.16 
 
 
429 aa  243  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  38.35 
 
 
441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  41.3 
 
 
407 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  38.82 
 
 
400 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  35.36 
 
 
410 aa  196  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  26.73 
 
 
425 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  25.79 
 
 
382 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  23.5 
 
 
359 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  29.52 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  23.18 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  31.03 
 
 
356 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  25.93 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  38.75 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  34.52 
 
 
374 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>