21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1076 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  60.09 
 
 
251 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  44.4 
 
 
231 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  34.62 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  32.05 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  31.91 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3530  hypothetical protein  31.49 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0348  hypothetical protein  30.29 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  29.28 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4168  hypothetical protein  34.01 
 
 
258 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.106721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  27.75 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.91 
 
 
545 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.62 
 
 
620 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
715 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  25.4 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
331 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
614 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
614 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.37 
 
 
626 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>