31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2261 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2261  Zinc finger, AN1-type  100 
 
 
415 aa  868    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0930  hypothetical protein  42.05 
 
 
357 aa  156  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1666  hypothetical protein  38.34 
 
 
305 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  38.27 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  31.4 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  35.58 
 
 
452 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  37.14 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0282  hypothetical protein  30.57 
 
 
368 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  41.12 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0402  hypothetical protein  32.17 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.723399  normal  0.0419743 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1753  hypothetical protein  43.01 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0323  hypothetical protein  31.9 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  31.91 
 
 
486 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  32.62 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0180  hypothetical protein  28.92 
 
 
449 aa  63.9  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.875793  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  34.59 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  64.1 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  64.1 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  61.54 
 
 
319 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  42.35 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  26.92 
 
 
521 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  46.81 
 
 
319 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  48.72 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  53.85 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1754  hypothetical protein  34 
 
 
341 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  51.28 
 
 
326 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2949  AN1-type Zinc finger protein  51.35 
 
 
90 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1787  AN1-type Zinc finger protein  50 
 
 
73 aa  47  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48928  predicted protein  51.35 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.710722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4851  hypothetical protein  29.45 
 
 
580 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>