27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2376 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  536  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2374  hypothetical protein  43.58 
 
 
286 aa  159  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0151554  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  31.75 
 
 
229 aa  89.4  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  31.6 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0251  hypothetical protein  27.86 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00204328  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0310  hypothetical protein  27.89 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685599  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  52.33 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0980  hypothetical protein  32.95 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186239  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0268  hypothetical protein  54.26 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.590609  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  65.52 
 
 
229 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0267  hypothetical protein  68.09 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.93762  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0299  hypothetical protein  58.23 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1534  hypothetical protein  46.88 
 
 
211 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000101739  normal  0.014347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  50.94 
 
 
152 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  32.52 
 
 
124 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2375  hypothetical protein  70 
 
 
233 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0026891  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  37.29 
 
 
151 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  40 
 
 
176 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  42.59 
 
 
169 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  41.07 
 
 
177 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  32.89 
 
 
161 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0541  hypothetical protein  45.28 
 
 
158 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  47.92 
 
 
158 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  55.56 
 
 
128 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  52.63 
 
 
149 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  52.63 
 
 
149 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  35.59 
 
 
169 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>