35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1534 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1534  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  423  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000101739  normal  0.014347 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  35.22 
 
 
229 aa  101  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1530  hypothetical protein  36.4 
 
 
235 aa  95.9  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000147864  normal  0.0283625 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  31.58 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  43.3 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0980  hypothetical protein  35.75 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186239  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0310  hypothetical protein  26.5 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685599  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  43.68 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0251  hypothetical protein  27.05 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00204328  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  63.64 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0268  hypothetical protein  30.4 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.590609  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1541  hypothetical protein  41.49 
 
 
160 aa  58.5  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000440251  hitchhiker  0.0000169675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0267  hypothetical protein  42.27 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.93762  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2373  hypothetical protein  44.25 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0949277  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  36.71 
 
 
152 aa  54.7  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  40.7 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2382  hypothetical protein  43 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00520194  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  51.92 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0299  hypothetical protein  53.95 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0252  hypothetical protein  44.16 
 
 
174 aa  48.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00157113  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0311  hypothetical protein  42.47 
 
 
168 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0328154  normal  0.464529 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  34.67 
 
 
157 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  51.06 
 
 
153 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  50 
 
 
169 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  39.34 
 
 
161 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  43.48 
 
 
136 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  39.34 
 
 
169 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  31.52 
 
 
131 aa  45.1  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2375  hypothetical protein  44.32 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0026891  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  43.48 
 
 
136 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  40.68 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2374  hypothetical protein  53.23 
 
 
286 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0151554  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  48.94 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  40 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  48.08 
 
 
151 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>