36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0980 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0980  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  423  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186239  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0268  hypothetical protein  53.85 
 
 
212 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.590609  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  44.1 
 
 
229 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  41.03 
 
 
229 aa  135  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0299  hypothetical protein  34.75 
 
 
232 aa  94  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0251  hypothetical protein  35.29 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00204328  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  33.08 
 
 
271 aa  88.6  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0310  hypothetical protein  31.9 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685599  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2382  hypothetical protein  35.65 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00520194  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  70 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  64.91 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1534  hypothetical protein  35.75 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000101739  normal  0.014347 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1541  hypothetical protein  26.87 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000440251  hitchhiker  0.0000169675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0267  hypothetical protein  62.5 
 
 
200 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.93762  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  41.46 
 
 
158 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  55.56 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  55.56 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0981  hypothetical protein  33.62 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.215812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0252  hypothetical protein  43.21 
 
 
174 aa  51.6  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00157113  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  44.9 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  34.52 
 
 
152 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  44.9 
 
 
151 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  60 
 
 
153 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0311  hypothetical protein  43.21 
 
 
168 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0328154  normal  0.464529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  57.89 
 
 
124 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  31.91 
 
 
177 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  47.73 
 
 
128 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  46 
 
 
161 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2417  hypothetical protein  48.08 
 
 
134 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.812754  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2373  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  45.1  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0949277  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  46 
 
 
169 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  45.65 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  45.1 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2375  hypothetical protein  51.95 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0026891  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  54.29 
 
 
128 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  52.94 
 
 
131 aa  42  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>