41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2375 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2375  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0026891  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2373  hypothetical protein  41.33 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0949277  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0311  hypothetical protein  42.47 
 
 
168 aa  86.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0328154  normal  0.464529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  50.56 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  52 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  68.75 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  70 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0267  hypothetical protein  41.94 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.93762  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  45.07 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0251  hypothetical protein  45.59 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00204328  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  43.02 
 
 
229 aa  62  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  34.13 
 
 
158 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0252  hypothetical protein  43.02 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00157113  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  40.45 
 
 
169 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0299  hypothetical protein  65.15 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0310  hypothetical protein  50 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685599  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  39.44 
 
 
131 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  38.75 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  37.33 
 
 
157 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  38.75 
 
 
149 aa  49.3  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  43.1 
 
 
128 aa  48.9  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  40 
 
 
136 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  38.33 
 
 
128 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  34.78 
 
 
161 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  37.68 
 
 
124 aa  45.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2374  hypothetical protein  54.29 
 
 
286 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0151554  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5067  hypothetical protein  31.71 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  38.33 
 
 
136 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  37.74 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1534  hypothetical protein  44.32 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000101739  normal  0.014347 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  28.24 
 
 
1814 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0268  hypothetical protein  49.35 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.590609  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  45.1 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1824  hypothetical protein  33.33 
 
 
435 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2382  hypothetical protein  44.33 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00520194  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1357  hypothetical protein  35.94 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  35.53 
 
 
177 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0981  hypothetical protein  71.74 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0867729  normal  0.215812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0980  hypothetical protein  51.95 
 
 
210 aa  42  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.186239  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1541  hypothetical protein  45.83 
 
 
160 aa  41.6  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000440251  hitchhiker  0.0000169675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>