29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3089 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3089  putative transposase  100 
 
 		 90 aa  179  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0561407  normal  0.0601235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2682  putative transposase  93.33 
 
 		 90 aa  150  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00783753  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1302  hypothetical protein  91.11 
 
 		 90 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.534193 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0690  IS1648 transposase  86.67 
 
 		 95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.194342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  58.43 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  58.43 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  50.56 
 
 		 181 aa  87.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  34.48 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  27.71 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  27.71 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  31.03 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  31.03 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  31.03 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  32.26 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  26.51 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  26.25 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  29.63 
 
 		 259 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  32.79 
 
 		 184 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  32.5 
 
 		 131 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  32.5 
 
 		 138 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  32.79 
 
 		 184 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  32.5 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  30.68 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  34.15 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  30.49 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0751  ISPs1, transposase OrfB  36.54 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  26.97 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>