165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0751 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0751  ISPs1, transposase OrfB  100 
 
 
101 aa  207  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  71.21 
 
 
145 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  71.21 
 
 
145 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  71.21 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  62.12 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4697  ISPs1, transposase OrfB  72.13 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  50.94 
 
 
135 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  44.64 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  47.69 
 
 
177 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  53.19 
 
 
177 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  53.19 
 
 
177 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  53.19 
 
 
177 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  53.19 
 
 
177 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  53.19 
 
 
177 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  55.56 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  48.94 
 
 
113 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33330  transposase IS4 family  47.46 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49850  transposase IS4 family  47.46 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.102835  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  40.74 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  40.74 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10840  transposase IS4 family  47.46 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09580  transposase IS4 family  47.46 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.899796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23940  transposase IS4 family  47.46 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36160  transposase IS4 family  47.46 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15010  transposase IS4 family  47.46 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  55.56 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  55.56 
 
 
171 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  46.81 
 
 
255 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0514  transposase, interruption-C  43.33 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.414231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  42.25 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  42.25 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  39.47 
 
 
260 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  39.47 
 
 
260 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  39.47 
 
 
260 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  39.47 
 
 
260 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  49.06 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  49.06 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  49.06 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  45.83 
 
 
294 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.08 
 
 
281 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.08 
 
 
281 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  48 
 
 
136 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0836  IS4 family transposase  51.11 
 
 
75 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  42.86 
 
 
95 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  41.67 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  41.67 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  41.67 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6290  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464291  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  44.26 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0355  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0436  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0573  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0738  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728772  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0936  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.156092  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0988  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1519  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2110  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.305302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2278  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0266  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0921  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3272  IS4 family transposase  48 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1015  ISCc1, transposase OrfB  46.3 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  41.67 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1108  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479399  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1124  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524829  hitchhiker  0.00145263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4244  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  43.33 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  39.58 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.89 
 
 
281 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  43.55 
 
 
266 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.89 
 
 
281 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  51.28 
 
 
251 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  51.28 
 
 
251 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3433  putative transposase  46.15 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520481  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6135  transposase IS4 family protein  46 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.766196 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6808  transposase IS4 family protein  46 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  44.64 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  44.44 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  38.24 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0596  hypothetical protein  55.26 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  38.24 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  38.24 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  38.24 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3451  hypothetical protein  55.26 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  38.24 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11059  transposase  46.94 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11174  transposase  46.94 
 
 
287 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  51.28 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  47.73 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  35.62 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.83 
 
 
252 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13890  transposase family protein  41.67 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.417706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>