27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1302 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1302  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.534193 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2682  putative transposase  92.22 
 
 		 90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00783753  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3089  putative transposase  91.11 
 
 		 90 aa  144  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0561407  normal  0.0601235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0690  IS1648 transposase  85.56 
 
 		 95 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.194342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  58.43 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  58.43 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  50.56 
 
 		 181 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  27.38 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  35.48 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 281 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  32.95 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  32.95 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  32.95 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  35.53 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  30.86 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 281 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  26.19 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  31.82 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.1 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  30.49 
 
 		 336 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  31.03 
 
 		 303 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  31.03 
 
 		 303 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  31.03 
 
 		 303 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>