23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0690 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0690  IS1648 transposase  100 
 
 
95 aa  191  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.194342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3089  putative transposase  86.67 
 
 
90 aa  140  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0561407  normal  0.0601235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2682  putative transposase  86.67 
 
 
90 aa  140  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00783753  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1302  hypothetical protein  85.56 
 
 
90 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.534193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  51.58 
 
 
140 aa  103  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  51.58 
 
 
140 aa  103  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2179  transposase IS4 family protein  43.16 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.488583  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  31.87 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  34.83 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  29.29 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  32.32 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00640  transposase family protein  29.79 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  26.97 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  31.63 
 
 
303 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  31.63 
 
 
303 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  31.63 
 
 
303 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  28.57 
 
 
294 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  25.84 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7095  transposase  29.07 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  29.07 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  29.07 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  31.48 
 
 
135 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>