27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0685 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0685  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 438 aa  872    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.80167  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0438  hypothetical protein  24.61 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2369  hypothetical protein  22.88 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00044505  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 189 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 750 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  31.48 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 209 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1521  TPR repeat-domain-containing protein SEL1 subfamily-like protein  37.61 
 
 		 471 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  hitchhiker  0.000333519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2188  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.77 
 
 		 801 aa  46.6  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.02 
 
 		 416 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  34.09 
 
 		 792 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6741  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 1478 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3564  hypothetical protein  35.42 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  35.42 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 827 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25 
 
 		 561 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 		 871 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.42 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.41 
 
 		 689 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25 
 
 		 561 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 315 aa  43.5  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>