18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2112 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2112  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  882    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0439  hypothetical protein  44.97 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286489  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0438  hypothetical protein  46.3 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0491  hypothetical protein  46.88 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1701  hypothetical protein  47.19 
 
 		 396 aa  338  8e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2005  hypothetical protein  42.92 
 
 		 415 aa  336  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87614  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0386  protein of unknown function DUF1597  35.65 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4410  hypothetical protein  28.75 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1304  hypothetical protein  25.25 
 
 		 421 aa  89.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1432  hypothetical protein  23.16 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1268  hypothetical protein  24.94 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0113688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4447  hypothetical protein  25.17 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  24.15 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  26.1 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3732  outer membrane protein  27.91 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1346  hypothetical protein  26.01 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.748859  normal  0.578477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0540  hypothetical protein  25.81 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1007  hypothetical protein  27.03 
 
 		 344 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>