24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1464 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1464  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2976  hypothetical protein  35.45 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00305374  hitchhiker  0.00646242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2459  hypothetical protein  33.9 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0862  putative transmembrane protein  28.32 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0133398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1006  putative transmembrane protein  28.32 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0490941 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1832  hypothetical protein  30.89 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1835  hypothetical protein  30.89 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01716  hypothetical protein  31.97 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.62979  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2087  transmembrane protein  30.28 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1346  hypothetical protein  28.32 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.325853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1389  hypothetical protein  31.09 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.686491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54340  hypothetical protein  21.19 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4750  hypothetical protein  22.03 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2246  hypothetical protein  26.79 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2244  hypothetical protein  24.14 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1474  hypothetical protein  20.49 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1948  hypothetical protein  24.07 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1091  hypothetical protein  28.7 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0652611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4218  hypothetical protein  21.55 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0331005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1120  hypothetical protein  27.19 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1399  hypothetical protein  27.19 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2313  hypothetical protein  28.3 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.303792  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1374  hypothetical protein  21.71 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2028  transmembrane protein  27.03 
 
 		 116 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>