26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01806 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01806  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 480 aa  978    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3774  hypothetical protein  53.36 
 
 		 480 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3609  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  41.8 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000164741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  38.43 
 
 		 475 aa  299  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4460  hypothetical protein  38.28 
 
 		 475 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267137  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.13 
 
 		 483 aa  240  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0684  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation permease component-like protein  28.13 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2048  hypothetical protein  29.03 
 
 		 487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.598539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01817  hypothetical protein  29.89 
 
 		 470 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5322  hypothetical protein  26.73 
 
 		 476 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  28.79 
 
 		 465 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0683  hypothetical protein  22.93 
 
 		 463 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4459  hypothetical protein  25.88 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448682  normal  0.0102439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3359  hypothetical protein  24.91 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3333  hypothetical protein  28.4 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3775  hypothetical protein  23.46 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  29.46 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2163  hypothetical protein  51.06 
 
 		 304 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.176689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  41.03 
 
 		 275 aa  46.6  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  25.66 
 
 		 289 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1524  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 		 277 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  49.02 
 
 		 274 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  40 
 
 		 271 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.03 
 
 		 354 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>