More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01289 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01289  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
195 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  56.11 
 
 
335 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  55.56 
 
 
350 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  56.91 
 
 
327 aa  208  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  52.41 
 
 
360 aa  204  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  54.44 
 
 
330 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  53.89 
 
 
330 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  50.53 
 
 
357 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  52.78 
 
 
353 aa  200  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  53.59 
 
 
319 aa  197  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  48.59 
 
 
320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  52.22 
 
 
338 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.67 
 
 
353 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.67 
 
 
353 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  52.22 
 
 
347 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.67 
 
 
353 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  49.2 
 
 
337 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  48.59 
 
 
320 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  52.78 
 
 
340 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  52.78 
 
 
347 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  52.78 
 
 
347 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  50.56 
 
 
334 aa  192  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  53.89 
 
 
348 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  50.56 
 
 
320 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  52.78 
 
 
347 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  52.78 
 
 
347 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  52.78 
 
 
347 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  53.89 
 
 
319 aa  190  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  51.34 
 
 
340 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  47.75 
 
 
321 aa  188  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  48.59 
 
 
341 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  50 
 
 
358 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  48.02 
 
 
330 aa  185  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  48.59 
 
 
330 aa  184  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  50.56 
 
 
358 aa  184  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  49.44 
 
 
373 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  49.44 
 
 
373 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  49.44 
 
 
342 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  46.77 
 
 
365 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  46.77 
 
 
365 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  48.59 
 
 
324 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  46.77 
 
 
365 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 
335 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  47.85 
 
 
359 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  46.89 
 
 
319 aa  181  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  48.02 
 
 
312 aa  181  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  45.3 
 
 
310 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.67 
 
 
332 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  50 
 
 
308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  50 
 
 
306 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  46.63 
 
 
311 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  46.93 
 
 
367 aa  178  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  46.63 
 
 
311 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  49.44 
 
 
308 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.75 
 
 
323 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  47.75 
 
 
323 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  47.19 
 
 
323 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  47.75 
 
 
323 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  48.04 
 
 
312 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.75 
 
 
323 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  49.44 
 
 
308 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  47.51 
 
 
332 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  49.44 
 
 
310 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  49.44 
 
 
306 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  48.89 
 
 
310 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  48.11 
 
 
334 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  44.2 
 
 
346 aa  174  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  49.44 
 
 
306 aa  174  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  47.78 
 
 
304 aa  174  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  45.81 
 
 
339 aa  174  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  45 
 
 
339 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  44.69 
 
 
343 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  47.22 
 
 
319 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  47.22 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  47.22 
 
 
309 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  46.93 
 
 
333 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  46.67 
 
 
309 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  44.69 
 
 
319 aa  168  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  45.86 
 
 
307 aa  168  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 
339 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  45.25 
 
 
324 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.26 
 
 
319 aa  166  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  44.13 
 
 
319 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  43.82 
 
 
356 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  45.81 
 
 
324 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  39.46 
 
 
336 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 
331 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  40.68 
 
 
327 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  43.02 
 
 
364 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 
345 aa  158  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  41.9 
 
 
366 aa  158  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
383 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  40 
 
 
337 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  41.99 
 
 
348 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  40.22 
 
 
341 aa  154  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  40.68 
 
 
312 aa  154  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  43.17 
 
 
343 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  42.78 
 
 
339 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  43.02 
 
 
312 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  42.25 
 
 
339 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>