More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00675 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  67.45 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  63.76 
 
 		 222 aa  291  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  63.51 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  63.51 
 
 		 217 aa  285  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  63.51 
 
 		 217 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  64.65 
 
 		 222 aa  279  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  64.62 
 
 		 221 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  64.93 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  62.91 
 
 		 219 aa  277  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  63.72 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  63.51 
 
 		 214 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  276  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  60.19 
 
 		 218 aa  275  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  63.98 
 
 		 222 aa  275  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  63.72 
 
 		 222 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  60.62 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  60.62 
 
 		 219 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  61.61 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  61.61 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  61.61 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  61.32 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  61.32 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  61.32 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  61.32 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  61.32 
 
 		 214 aa  271  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  61.14 
 
 		 216 aa  270  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  61.79 
 
 		 216 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  60.38 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  64.62 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  64.45 
 
 		 220 aa  257  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 		 222 aa  255  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  59.62 
 
 		 220 aa  247  8e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  64.93 
 
 		 217 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  51.01 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  50.77 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  47.69 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  50.26 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  46.39 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  38.42 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  40.21 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3990  GTP cyclohydrolase I  35.14 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497334  normal  0.07815 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  40.45 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  41.9 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  43.45 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  39.56 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  40.33 
 
 		 200 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  42.94 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  42.37 
 
 		 202 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  42.94 
 
 		 214 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  39.66 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  41.76 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  39.57 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  41.81 
 
 		 193 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  37.04 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  40 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  40.33 
 
 		 185 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  41.07 
 
 		 185 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1074  GTP cyclohydrolase  36.22 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1278  GTP cyclohydrolase I  36.61 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00712716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  42.37 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  41.18 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  42.37 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  42.37 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  37.5 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  39.44 
 
 		 192 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  40.22 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 190 aa  124  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  41.44 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  42.26 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  41.18 
 
 		 187 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  37.7 
 
 		 193 aa  123  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3631  GTP cyclohydrolase  35.14 
 
 		 267 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  37.26 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  37.91 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  36.02 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  40.78 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5449  GTP cyclohydrolase I  38.55 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  40.59 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  43.02 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  40.33 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  37.99 
 
 		 216 aa  122  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05621  putative GTP cyclohydrolase I  34.08 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>