38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4161 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  49.54 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  49.11 
 
 		 119 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1586  hypothetical protein  46.43 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0480  hypothetical protein  44.64 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1946  hypothetical protein  43.36 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1939  hypothetical protein  41.03 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00181312  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2380  hypothetical protein  42.48 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000201201  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1913  hypothetical protein  42.74 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000103196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1906  hypothetical protein  43.52 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3882  hypothetical protein  48 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0370234  normal  0.0307082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  34.78 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  38.38 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  35.92 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  34.78 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  33.88 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  34.78 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  33.88 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  33.88 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  33.88 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  31.36 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  36.28 
 
 		 396 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  31.68 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  32.63 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  32.32 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  32.63 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  31.82 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  35.87 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  32.43 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  35.87 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4979  Domain of unknown function DUF1801  30.85 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  39.22 
 
 		 210 aa  42  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  31.18 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  32.94 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  33.78 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2625  hypothetical protein  40.91 
 
 		 109 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>