More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3516 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  100 
 
 		 80 aa  166  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  79.75 
 
 		 91 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  75 
 
 		 85 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  73.75 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  76.25 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  76.25 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  73.75 
 
 		 86 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  71.25 
 
 		 87 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  71.25 
 
 		 87 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  68.75 
 
 		 82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  70.89 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  71.25 
 
 		 86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  68.75 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  68.75 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 83 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  67.5 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  67.5 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  67.5 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  67.5 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  66.25 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  66.25 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  65 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  64.1 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  66.67 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  66.25 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  60 
 
 		 89 aa  106  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  62.5 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  63.29 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  59.49 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  61.25 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  61.25 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  58.97 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  56.25 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  55 
 
 		 86 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  57.69 
 
 		 96 aa  94  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  55 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  55 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  56.96 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  56.96 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  56.79 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  56.96 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  56.96 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  53.85 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  51.28 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  57.69 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  57.69 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  57.69 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  54.43 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  56.41 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  55.7 
 
 		 83 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  55.13 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  55.13 
 
 		 83 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  52.56 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  57.5 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  53.85 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  53.16 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  55.7 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  52.56 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  53.16 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  55 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  58.54 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  56.25 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  55 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 85 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  52.56 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  56.96 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  55.7 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  48.75 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  55.56 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  54.43 
 
 		 85 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  55.7 
 
 		 86 aa  84.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  53.75 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  55.7 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  53.85 
 
 		 82 aa  84.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  54.32 
 
 		 85 aa  83.6  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>