257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1785 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  286  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  77.78 
 
 		 150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  75.34 
 
 		 150 aa  214  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  73.97 
 
 		 148 aa  206  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  69.59 
 
 		 148 aa  204  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  68.21 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  71.22 
 
 		 148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  74.66 
 
 		 148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  68.92 
 
 		 149 aa  193  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  72.6 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  68.49 
 
 		 149 aa  190  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  66.44 
 
 		 152 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  66.44 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2348  GatB/YqeY domain-containing protein  70.2 
 
 		 153 aa  182  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0884151  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  63.01 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  63.01 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  68.49 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  68.49 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  65.75 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  67.12 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  65.73 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  66.44 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  65.07 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  66.44 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  65.75 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  67.81 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  67.81 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  67.81 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  67.81 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  67.81 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1387  GatB/Yqey domain-containing protein  70.2 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000956621  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  67.81 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  67.81 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3781  GatB/YqeY domain-containing protein  66.44 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472621  normal  0.0350556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3255  GatB/Yqey domain-containing protein  66.44 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  67.12 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0528  hypothetical protein  60.27 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  51.37 
 
 		 148 aa  156  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  56.85 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  53.79 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  55.94 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  55.94 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  53.79 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  56.74 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  48.63 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  51.39 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  55.24 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  50.68 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  48.98 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  53.79 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  48.63 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  49.66 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  49.66 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  48.98 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  49.66 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  49.32 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  49.32 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  49.32 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  47.95 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  50.35 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  47.22 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  46.26 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  45.89 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  45.21 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  49.66 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  45.58 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  44.22 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  47.22 
 
 		 148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  46.58 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  41.78 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  47.22 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  45.52 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  45.83 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  48.48 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  46.58 
 
 		 147 aa  121  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  45.89 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  43.26 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  43.45 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  42.76 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2906  GatB/Yqey domain-containing protein  50.34 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160635  normal  0.0394682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  43.45 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  42.76 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  42.55 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  46.67 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  42.95 
 
 		 513 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2988  GatB/Yqey domain-containing protein  49.66 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  42.76 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3085  GatB/Yqey domain-containing protein  49.66 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000446062  hitchhiker  0.00030049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  47.55 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  44.59 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>