21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1006 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1006  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 441 aa  880    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1033  FirrV-1-B8  31.76 
 
 		 254 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 568 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4735  hypothetical protein  36.96 
 
 		 225 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 589 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 627 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1005 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 808 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 		 602 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 927 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 718 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28 
 
 		 764 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3615  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.242924  normal  0.313882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.92 
 
 		 587 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  32.1 
 
 		 924 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  36.44 
 
 		 990 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  35.87 
 
 		 1309 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  24.07 
 
 		 892 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 776 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.97 
 
 		 875 aa  43.1  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>