21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24260  predicted DNA-binding protein with an HTH domain  100 
 
 		 77 aa  150  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10640  hypothetical protein  41.33 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1626  CopG domain protein DNA-binding domain protein  48.57 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00111778  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3570  CopG-like DNA-binding protein  46.48 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00677722  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4391  helix-turn-helix protein, CopG  43.06 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2095  CopG domain protein DNA-binding domain protein  44.29 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1339  CopG domain protein DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1377  CopG family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0599  helix-turn-helix protein, CopG  40.54 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1291  anti-toxin protein  41.89 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1260  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.89 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3232  hypothetical protein  43.42 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.706269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1616  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.89 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000428775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3195  helix-turn-helix protein, CopG  42.19 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0379  CopG domain-containing protein DNA-binding domain-containing protein  44.29 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0194  toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1569  CopG domain protein DNA-binding domain protein  40.58 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0720  transcriptional regulator, CopG family  35.71 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000059078 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4372  CopG family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3519  transcriptional regulator, CopG family  41.3 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1179  transcriptional regulator, CopG family  37.5 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>