30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06230 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06230  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.98748  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25600  hypothetical protein  57.39 
 
 
239 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.52807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1319  hypothetical protein  45.69 
 
 
235 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0260  hypothetical protein  39.31 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000331823  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1604  hypothetical protein  31.93 
 
 
241 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352848  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  36 
 
 
281 aa  99.4  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
616 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 
613 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2243  hypothetical protein  30.77 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.116823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3580  hypothetical protein  37.29 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1602  hypothetical protein  39.52 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1631  hypothetical protein  35.94 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1052  hypothetical protein  26.92 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.0269502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
520 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2929  hypothetical protein  31.25 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.593374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0765  hypothetical protein  32.28 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.389785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2140  hypothetical protein  43.82 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1036  hypothetical protein  34.44 
 
 
123 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1173  hypothetical protein  27.14 
 
 
187 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5534  hypothetical protein  31.54 
 
 
172 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1886  hypothetical protein  31.01 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2854  hypothetical protein  25.42 
 
 
179 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000499233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1850  hypothetical protein  31.01 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4343  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0598525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1412  hypothetical protein  27.73 
 
 
195 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.709338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0369  hypothetical protein  28.7 
 
 
127 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0475  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3653  hypothetical protein  32.5 
 
 
407 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0709  hypothetical protein  23.33 
 
 
163 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1522  hypothetical protein  30.53 
 
 
411 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>