36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4573 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  52.15 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  53.85 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  48.9 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  46.96 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  44.15 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  51.5 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  55.15 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  44.68 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  51.52 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  41.99 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  41.99 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  44.92 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  41.99 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  46.78 
 
 		 220 aa  148  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  46.41 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  45.86 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  44.03 
 
 		 223 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  39.78 
 
 		 210 aa  137  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  46.94 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  44.9 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  45.03 
 
 		 181 aa  134  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  39.89 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  42.86 
 
 		 246 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  43.17 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  43.44 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  35.56 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  37.02 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  37.41 
 
 		 247 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  31.74 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  37.82 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  31.89 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  39.83 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  32.61 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  25.67 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  26.92 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>