More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4330 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4330  luciferase family protein  100 
 
 
329 aa  651    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0607996  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0138  luciferase family oxidoreductase, group 1  67.78 
 
 
329 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.402113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3897  luciferase family protein  65.33 
 
 
329 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12570  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  67.16 
 
 
335 aa  424  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6408  luciferase-like monooxygenase  66.26 
 
 
329 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3681  Luciferase-like monooxygenase  63.78 
 
 
330 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02130  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  61.3 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3277  luciferase family oxidoreductase, group 1  61.11 
 
 
340 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.967037  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13410  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.63 
 
 
334 aa  350  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.137894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3168  Luciferase-like monooxygenase  56.11 
 
 
333 aa  345  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00022077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2471  Luciferase-like monooxygenase  54.37 
 
 
350 aa  328  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.591573  normal  0.033283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  54.49 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  54.88 
 
 
343 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  54.88 
 
 
343 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  54.66 
 
 
328 aa  311  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  52.13 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  51.68 
 
 
337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  54.35 
 
 
346 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  47.09 
 
 
334 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  53.61 
 
 
397 aa  305  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  53.7 
 
 
335 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  49.85 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  52.71 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  52.71 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  52.71 
 
 
332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  52.57 
 
 
332 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  53.12 
 
 
335 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  52.89 
 
 
352 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  52.89 
 
 
352 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  52.89 
 
 
336 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  52.89 
 
 
424 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  52.89 
 
 
336 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  52.89 
 
 
352 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  51.82 
 
 
332 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  51.95 
 
 
332 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  51.54 
 
 
338 aa  298  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  51.36 
 
 
332 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  51.25 
 
 
335 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  48.04 
 
 
335 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  49.7 
 
 
353 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  48.63 
 
 
331 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  50.93 
 
 
343 aa  292  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  49.08 
 
 
327 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  48.04 
 
 
335 aa  291  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  47.55 
 
 
330 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  50.75 
 
 
336 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  47.73 
 
 
335 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  47.73 
 
 
335 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  47.73 
 
 
335 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  47.73 
 
 
335 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  51.07 
 
 
333 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  47.73 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  47.73 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  50.15 
 
 
331 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  50.3 
 
 
331 aa  288  7e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  48.18 
 
 
331 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0714  luciferase family protein  48.8 
 
 
335 aa  288  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  48.34 
 
 
335 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  48.33 
 
 
335 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1154  luciferase-like  47.69 
 
 
339 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.111277  normal  0.95241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  47.43 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1238  putative luciferase  47.53 
 
 
339 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.816802  normal  0.894284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  49.38 
 
 
341 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  49.23 
 
 
335 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  48.04 
 
 
335 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  49.08 
 
 
327 aa  286  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1360  luciferase-like protein  51.06 
 
 
345 aa  285  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675179  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  47.37 
 
 
336 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  49.54 
 
 
347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  48.94 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  48.92 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  48.77 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  48.75 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  49.24 
 
 
351 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  49.23 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  49.24 
 
 
351 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  48.48 
 
 
338 aa  281  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  50.15 
 
 
337 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  49.54 
 
 
333 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  47.68 
 
 
331 aa  278  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3215  Luciferase-like monooxygenase  47.81 
 
 
333 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  47.11 
 
 
333 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  47.69 
 
 
328 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  43.47 
 
 
338 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1776  luciferase family protein  47.5 
 
 
333 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  49.69 
 
 
333 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1808  luciferase-like  45.29 
 
 
334 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0513  luciferase family protein  43.43 
 
 
333 aa  275  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  51.7 
 
 
348 aa  275  9e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  45.45 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  45.29 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5700  luciferase family protein  48.15 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0210  luciferase-like  50 
 
 
330 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  46.63 
 
 
333 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0664  luciferase family protein  47.83 
 
 
343 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.860501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  46.63 
 
 
333 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  44.85 
 
 
334 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  43.69 
 
 
328 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  48.59 
 
 
333 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>