119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1097 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  100 
 
 
476 aa  924    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  69.31 
 
 
463 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  69.81 
 
 
471 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  68.7 
 
 
465 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  67.45 
 
 
473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  64.64 
 
 
475 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  69.63 
 
 
461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  68.71 
 
 
469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  67.23 
 
 
503 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  67.6 
 
 
475 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  66.23 
 
 
461 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  64.39 
 
 
462 aa  548  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  66.23 
 
 
461 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  66.23 
 
 
461 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  63.89 
 
 
511 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  63.87 
 
 
480 aa  547  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  63.46 
 
 
463 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  63.68 
 
 
463 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  63.4 
 
 
469 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  68.09 
 
 
464 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  65.59 
 
 
507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  63.93 
 
 
459 aa  512  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  62.09 
 
 
478 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  64.63 
 
 
477 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  50.21 
 
 
464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.01 
 
 
505 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  50.75 
 
 
460 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.63 
 
 
475 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.37 
 
 
502 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  49.6 
 
 
487 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.07 
 
 
499 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  41.65 
 
 
510 aa  354  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  46.74 
 
 
487 aa  354  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  42.46 
 
 
512 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  47.24 
 
 
510 aa  349  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.42 
 
 
486 aa  340  4e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  38.94 
 
 
497 aa  339  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  44.6 
 
 
473 aa  336  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  42.2 
 
 
473 aa  323  4e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.16 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.75 
 
 
357 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.71 
 
 
373 aa  62  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.33 
 
 
358 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.33 
 
 
358 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.39 
 
 
341 aa  60.1  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.73 
 
 
369 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.78 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  28.62 
 
 
306 aa  59.3  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  28.51 
 
 
334 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  28.51 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.58 
 
 
341 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  31.06 
 
 
368 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.54 
 
 
337 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.96 
 
 
337 aa  57  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  25.48 
 
 
334 aa  56.6  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  28.09 
 
 
334 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.79 
 
 
336 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.06 
 
 
337 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.29 
 
 
364 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.78 
 
 
362 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.05 
 
 
363 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  24.47 
 
 
307 aa  53.5  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  28.77 
 
 
334 aa  53.5  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.86 
 
 
340 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.51 
 
 
340 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  23.73 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.97 
 
 
324 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.45 
 
 
340 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  25.31 
 
 
304 aa  50.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.69 
 
 
340 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.48 
 
 
362 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.39 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  26.64 
 
 
339 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  26.49 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  27.1 
 
 
362 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  25.38 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.91 
 
 
348 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.89 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.4 
 
 
394 aa  48.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  30.98 
 
 
670 aa  48.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.96 
 
 
391 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  30.21 
 
 
660 aa  48.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  27.78 
 
 
637 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  27.31 
 
 
309 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.52 
 
 
384 aa  47.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.99 
 
 
362 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.77 
 
 
322 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.4 
 
 
327 aa  47  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.43 
 
 
386 aa  47  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  23.3 
 
 
349 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  30.17 
 
 
309 aa  47  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  25.6 
 
 
326 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  26.54 
 
 
356 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.89 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  25.41 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.7 
 
 
306 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  31.05 
 
 
719 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  25.41 
 
 
362 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.15 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0878  hypothetical protein  30 
 
 
321 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000906257  hitchhiker  0.00000551742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>