23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3230 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3230  conjugal transfer TraD  100 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4224  conjugal transfer TraD  82.72 
 
 		 81 aa  136  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0545637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4518  conjugal transfer TraD  70.89 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2655  conjugal transfer TraD family protein  68.35 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0270  conjugal transfer TraD family protein  68.35 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0619355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3948  conjugal transfer TraD  65.82 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0098  conjugal transfer TraD family protein  73.97 
 
 		 81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0437  conjugal transfer protein traD  71.43 
 
 		 72 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0147  conjugal transfer TraD  71.23 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0996  conjugal transfer TraD  65.82 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000550634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2274  conjugal transfer TraD  66.23 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.667805  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0440  conjugal transfer TraD family protein  69.57 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13579  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1545  conjugal transfer TraD  64.29 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358728  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3193  conjugal transfer TraD  57.75 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0328  conjugal transfer TraD family protein  49.33 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1150  conjugal transfer TraD family protein  56.06 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0126783  hitchhiker  0.0000022316 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3573  Conjugal transfer TraD family protein  53.09 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0180  conjugal transfer TraD family protein  57.14 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5395  conjugal transfer protein TraD  51.61 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.457429 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5516  Conjugal transfer TraD family protein  48.39 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184996  normal  0.022587 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9590  conjugal transfer protein Dtr system  44 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5050  conjugal transfer TraD family protein  52.08 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.609822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4243  hypothetical protein  39.44 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>