25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2875 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  71.65 
 
 
131 aa  200  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  63.91 
 
 
133 aa  176  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  61.65 
 
 
133 aa  173  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  60.9 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  60.77 
 
 
132 aa  170  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  59.23 
 
 
141 aa  166  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  55.73 
 
 
136 aa  160  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  60.47 
 
 
141 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  54.2 
 
 
135 aa  157  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  54.55 
 
 
133 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  54.55 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  53.79 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  54.2 
 
 
132 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  53.79 
 
 
132 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  53.91 
 
 
139 aa  144  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  52.8 
 
 
134 aa  141  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  50 
 
 
134 aa  141  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  46.03 
 
 
135 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  48.31 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  34.96 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  34.13 
 
 
146 aa  48.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  24.17 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  25.4 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>