34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0898 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0898  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  100 
 
 		 370 aa  718    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  51.57 
 
 		 391 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0447  extracellular ligand-binding receptor  47.66 
 
 		 394 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.766827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1812  hypothetical protein  49.32 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0459  hypothetical protein  49.32 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3957  hypothetical protein  44.33 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2832  hypothetical protein  48.26 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0190613  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3584  extracellular ligand-binding receptor  33.91 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0291  Extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3694  hypothetical protein  32.46 
 
 		 408 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.61828  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4012  hypothetical protein  29.57 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  30.25 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 399 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3284  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3012  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  29.36 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2940  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0472  extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2581  hypothetical protein  30.03 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0732986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  27.64 
 
 		 402 aa  89.7  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.92 
 
 		 394 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0023  extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 		 404 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0026  Extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3138  hypothetical protein  26.93 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  27.13 
 
 		 631 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 		 409 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>