27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0113 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1089    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  31.04 
 
 
547 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  30.09 
 
 
545 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  26.36 
 
 
542 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  25.19 
 
 
550 aa  97.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  22.18 
 
 
551 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  27.25 
 
 
586 aa  94  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  25.91 
 
 
548 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  23.93 
 
 
550 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  21.52 
 
 
552 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  21.29 
 
 
555 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  21.29 
 
 
552 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  24.44 
 
 
558 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  27.17 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  21.8 
 
 
545 aa  77  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  26.3 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  23.88 
 
 
551 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  24.36 
 
 
578 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  22.83 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  20.83 
 
 
509 aa  57.4  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  24.83 
 
 
521 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  21.44 
 
 
624 aa  55.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  22.28 
 
 
538 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  21.91 
 
 
492 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  24.24 
 
 
536 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  24 
 
 
477 aa  47  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  27.01 
 
 
788 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.2775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>