18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2050 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2050  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0713  protein of unknown function DUF88  80 
 
 
154 aa  219  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1242  protein of unknown function DUF88  68.18 
 
 
164 aa  179  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1879  protein of unknown function DUF88  70.63 
 
 
152 aa  177  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.201136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2748  protein of unknown function DUF88  68.94 
 
 
148 aa  175  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  45.99 
 
 
183 aa  122  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  45.19 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1300  hypothetical protein  40.41 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  40.77 
 
 
215 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  40.77 
 
 
215 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  40.46 
 
 
215 aa  100  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  40.77 
 
 
193 aa  100  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  40.3 
 
 
193 aa  100  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  28.95 
 
 
787 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  28.95 
 
 
842 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  26.75 
 
 
600 aa  44.3  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  28.7 
 
 
260 aa  41.6  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  32.88 
 
 
251 aa  41.2  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>