28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0320 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0320  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2705  transcriptional regulator, TrmB  61.95 
 
 		 125 aa  147  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0781  transcriptional regulator, TrmB  55.83 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.44791 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0014  transcriptional regulator, TrmB  36.61 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.682046  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0728  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.22819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0154  transcriptional regulator, TrmB  33.04 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.487715  normal  0.0526976 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1748  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0714  transcriptional regulator, TrmB  32.38 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2097  transcriptional regulator TrmB  31.53 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2742  transcriptional regulator, TrmB  37.38 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0817  transcriptional regulator, TrmB  27.83 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4295  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3986  transcriptional regulator, TrmB  27.27 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.958939  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3632  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1080  hypothetical protein  22.43 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0146  transcriptional regulator, TrmB  27.88 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2144  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3390  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1140  hypothetical protein  24.53 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0951  transcriptional regulator, TrmB  34.02 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1935  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  32.56 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2240  transcriptional regulator, TrmB  36.9 
 
 		 214 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0847  transcriptional regulator, TrmB  27.5 
 
 		 205 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.32 
 
 		 149 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1275  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1905  IclR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 254 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>