40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6035 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6035  Abortive infection protein  100 
 
 
243 aa  463  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1269  abortive infection protein  37.02 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1257  Abortive infection protein  37.16 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1358  Abortive infection protein  37 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.098484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2591  abortive infection protein  47.83 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.965098  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07180  CAAX amino terminal protease family  44.57 
 
 
306 aa  62  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2393  abortive infection protein  40 
 
 
159 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000919744 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  29.03 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  32.63 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  39.62 
 
 
396 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  35.42 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  35.77 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  31.76 
 
 
277 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  29 
 
 
288 aa  48.9  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3231  abortive infection protein  32.2 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  36.67 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  31.13 
 
 
271 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0189  Abortive infection protein  32.48 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0257996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1632  abortive infection protein  37.78 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  30.34 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  30.34 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  30.77 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0665  Abortive infection protein  30.28 
 
 
160 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  29.47 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0052  abortive infection protein  27.27 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.184729  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0580  Abortive infection protein  30.19 
 
 
159 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000484212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  42.31 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3058  Abortive infection protein  30.28 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  30.34 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1797  CAAX amino terminal protease family protein  36.56 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0794  abortive infection protein  36 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  28.42 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  32.29 
 
 
299 aa  42.4  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  29.25 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  33.67 
 
 
265 aa  42  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  35.96 
 
 
246 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  31 
 
 
278 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>