16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5370 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  949    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  30.77 
 
 		 870 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  26.6 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  23.51 
 
 		 1222 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  24.51 
 
 		 1223 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1228 aa  53.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  40.66 
 
 		 925 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  23.48 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  25.65 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  31.07 
 
 		 886 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  23.87 
 
 		 855 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  33.7 
 
 		 913 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1224 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  28.8 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  36.36 
 
 		 913 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>