More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3908 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3908  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 376 aa  745    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.94 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.38 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.19 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.68 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.81 
 
 		 342 aa  378  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.96 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.62 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0561  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.74 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.389647  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  57.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.61 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.61 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.82 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.85 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.06 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.31 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.88 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.86 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.47 
 
 		 335 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6906  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.24 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.36 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3069  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672447  normal  0.509611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.59 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 		 334 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.2 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  57.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.15 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.35 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.37 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.91 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.91 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.1 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.8 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1292  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0997  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.57 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.73 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.46 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.92 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.98 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.93 
 
 		 348 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.48 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.05 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.84 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.33 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.41 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.64 
 
 		 369 aa  368  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.55 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1014  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 338 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1011  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.1 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5235  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.45 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.58 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.98 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 343 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.39 
 
 		 357 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.21 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.96 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.64 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.07 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.74 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.21 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.24 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.66 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>