18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3511 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3511  hypothetical protein  100 
 
 		 926 aa  1734    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  23.13 
 
 		 1202 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.21 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  24.82 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  20.1 
 
 		 2272 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.46 
 
 		 753 aa  56.2  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4143  hypothetical protein  28.6 
 
 		 773 aa  54.3  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4169  hypothetical protein  29.08 
 
 		 773 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.10155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  28.17 
 
 		 727 aa  53.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  28.08 
 
 		 693 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  25.7 
 
 		 4761 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  20.05 
 
 		 2179 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  31.18 
 
 		 804 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  21.68 
 
 		 3393 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4027  hypothetical protein  27.49 
 
 		 773 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657369  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 781 aa  45.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 		 814 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0911  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.36 
 
 		 632 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0440438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>