21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1936 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1936  APHP domain protein  100 
 
 		 1074 aa  2134    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620471  normal  0.229187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  30.01 
 
 		 6109 aa  184  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  27.95 
 
 		 2030 aa  173  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.62 
 
 		 1454 aa  161  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  29.03 
 
 		 1748 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.04 
 
 		 953 aa  115  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  31.74 
 
 		 1613 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  30.6 
 
 		 405 aa  99.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  25.99 
 
 		 2528 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0498  APHP  26.06 
 
 		 545 aa  63.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  26.54 
 
 		 1619 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.61 
 
 		 1726 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  26.98 
 
 		 2632 aa  55.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.56 
 
 		 627 aa  53.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.68 
 
 		 5216 aa  51.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  27.32 
 
 		 631 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  25.55 
 
 		 926 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  28.38 
 
 		 1378 aa  48.5  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1200 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1213 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  27.83 
 
 		 620 aa  45.8  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>