127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1584 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1584  protein of unknown function DUF692  100 
 
 
299 aa  604  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  33.47 
 
 
278 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  28.92 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  32.74 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  31.62 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  34.03 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  31.08 
 
 
299 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4743  protein of unknown function DUF692  36.03 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  31.08 
 
 
299 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  31.08 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  31.08 
 
 
299 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  36.65 
 
 
283 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  33.58 
 
 
291 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  34.62 
 
 
278 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  32.75 
 
 
285 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  31.3 
 
 
288 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  31.3 
 
 
288 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  31.75 
 
 
319 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1557  hypothetical protein  36.1 
 
 
286 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.189943  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  32.45 
 
 
287 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  32.11 
 
 
283 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1763  protein of unknown function DUF692  34.17 
 
 
297 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.944957  normal  0.0149585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  31.53 
 
 
293 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  31.53 
 
 
293 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  31.53 
 
 
293 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  34.51 
 
 
283 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  34.62 
 
 
339 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  30.2 
 
 
290 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6045  hypothetical protein  30.89 
 
 
283 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0730342  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  30.94 
 
 
303 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  29.83 
 
 
292 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  30.12 
 
 
292 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  29.89 
 
 
289 aa  99.4  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1559  hypothetical protein  33.59 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  32.85 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  31.22 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  32.61 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  33.51 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  26.52 
 
 
295 aa  96.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  31.12 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  35.23 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  35.6 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  28.06 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  35.08 
 
 
277 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  29.35 
 
 
289 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  28.06 
 
 
289 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  35.87 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  32.27 
 
 
276 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  30.54 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  29.67 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  30.97 
 
 
283 aa  92.8  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  28.35 
 
 
288 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  30.09 
 
 
279 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  34.36 
 
 
278 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  29.28 
 
 
367 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21580  hypothetical protein  34.67 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  30.5 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  35.42 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  35.08 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  29.35 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3295  hypothetical protein  36.17 
 
 
272 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  28.31 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4348  hypothetical protein  31.45 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  32.99 
 
 
308 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2533  hypothetical protein  32.34 
 
 
309 aa  89  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  31.25 
 
 
277 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  33.16 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  29.67 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1837  hypothetical protein  33.04 
 
 
284 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  30.05 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  30.17 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2492  protein of unknown function DUF692  29.22 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  28.27 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1735  hypothetical protein  34.48 
 
 
460 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0241629  decreased coverage  0.000466005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  30.68 
 
 
300 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  27.89 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  34.31 
 
 
311 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3068  hypothetical protein  34.57 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.125457 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  27.69 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2688  hypothetical protein  33.16 
 
 
297 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118004  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  29.17 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  32.98 
 
 
276 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  26.29 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  33 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  31.4 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  30.22 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  30.77 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  31.25 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  31.25 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  29.03 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  30.22 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  25.98 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  29.9 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  31.46 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  30.69 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  28.22 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  28.09 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  31.32 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.867164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>