128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4348 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4348  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  28.87 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  34.85 
 
 		 278 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  28.52 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  29.45 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  32.56 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  34.38 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  29.59 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6045  hypothetical protein  31.44 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0730342  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21580  hypothetical protein  32.05 
 
 		 284 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  33.62 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  27.06 
 
 		 284 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1837  hypothetical protein  31.66 
 
 		 284 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  31.28 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  27.56 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  32.64 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  28.67 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  26.43 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  30.99 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  30.89 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  31.8 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  26.94 
 
 		 292 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  33.03 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  34.91 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  30.25 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  32.16 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  32.16 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  29.58 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  26.33 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  27.37 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  28.32 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  28.42 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  30.39 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  27.91 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  27.14 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  30.94 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  27.4 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  29.58 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  28 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  30.9 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  29.49 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  27.84 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  29.49 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  30.12 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2533  hypothetical protein  30.95 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  24.31 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  27.66 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  27.47 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  31.58 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  26.69 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  27 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  29.33 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  28.88 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  26.07 
 
 		 299 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  25.72 
 
 		 275 aa  99.4  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  29.46 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1584  protein of unknown function DUF692  30.82 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  27.24 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  27.11 
 
 		 279 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  26.07 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  26.07 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  31.95 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  24.32 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  32.89 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  26.07 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  28.47 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  26.57 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  26.6 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  29.22 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  29.34 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  29.34 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  27.14 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  26.07 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  32.43 
 
 		 276 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  30.8 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1557  hypothetical protein  30.26 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.189943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  30.07 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  27.84 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  26.34 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0025  hypothetical protein  29.51 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  24.29 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1533  hypothetical protein  29.51 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  26.43 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1178  hypothetical protein  29.51 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1458  hypothetical protein  29.51 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0045  hypothetical protein  29.51 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0031  hypothetical protein  29.51 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0031  hypothetical protein  29.51 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  26.88 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  28.95 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  26.88 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  26.47 
 
 		 283 aa  93.2  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4743  protein of unknown function DUF692  32.73 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  28.51 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  30.41 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0028  hypothetical protein  28.12 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  28 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  30.22 
 
 		 276 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  26.41 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181481 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>