126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2688 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2688  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  54.51 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  49.24 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  42.76 
 
 		 290 aa  245  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  48.88 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  45.39 
 
 		 275 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  47.41 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  45.39 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  49.47 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2533  hypothetical protein  49.45 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  47.1 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  46.67 
 
 		 300 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  47.62 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  42.34 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  44.25 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  44.06 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  45.52 
 
 		 303 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  45.52 
 
 		 293 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  49.63 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  41.73 
 
 		 279 aa  222  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  39.93 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  37.81 
 
 		 284 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  39.93 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  45.56 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  45.67 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  43.89 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  45.67 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  42.75 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  40.29 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  47.58 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  43.33 
 
 		 298 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  43.97 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  43.33 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  41.33 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  45.02 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  43.33 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  40.43 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  39.71 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  45.79 
 
 		 280 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  37.22 
 
 		 289 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  47.45 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  41.42 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  38.85 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  47.62 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  38.25 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  36.09 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  39.21 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  38.75 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  38.85 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  44.36 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  38.85 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  39.49 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  37.77 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  36.26 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  37.77 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  37.41 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  43.75 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  37.41 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  38.46 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  43.75 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0811  hypothetical protein  35.61 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5627  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1557  hypothetical protein  41.76 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.189943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  34.28 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  34.57 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  40.74 
 
 		 277 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  40.07 
 
 		 277 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  34.44 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  34.78 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  36.19 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  37.55 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  38.93 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  36.82 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  40.15 
 
 		 276 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  39.1 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  33.93 
 
 		 277 aa  146  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  35.82 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  37.81 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  37.81 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  32.31 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  32.24 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  33.7 
 
 		 283 aa  139  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  33.09 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  33.45 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  36.36 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  36.81 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  33.1 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  32.45 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  32.2 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  34.21 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  35.07 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  33.83 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  33.83 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  32.76 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  34.04 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  32.37 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  31.16 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  31.73 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  32.41 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  32.26 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>