126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1735 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1735  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  874    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0241629  decreased coverage  0.000466005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3068  hypothetical protein  60.85 
 
 
272 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.125457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3295  hypothetical protein  59.92 
 
 
272 aa  252  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1559  hypothetical protein  53.47 
 
 
266 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0584838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1153  protein of unknown function DUF692  44.32 
 
 
297 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.298078  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  34.93 
 
 
279 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  34.13 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  31.64 
 
 
305 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  29.52 
 
 
319 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  30.77 
 
 
312 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  31.06 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  30.68 
 
 
287 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  30.86 
 
 
299 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  29.86 
 
 
292 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  32.96 
 
 
278 aa  126  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  32.42 
 
 
318 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  30.86 
 
 
299 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  30.47 
 
 
299 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  28.68 
 
 
310 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  32.32 
 
 
303 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  29.69 
 
 
299 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  32.16 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  28.93 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  28.93 
 
 
293 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  32.16 
 
 
308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  28.93 
 
 
293 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  31.91 
 
 
289 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  35.23 
 
 
278 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  34.67 
 
 
311 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  31.25 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  35.45 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  37.93 
 
 
283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  29.96 
 
 
367 aa  111  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6045  hypothetical protein  31.15 
 
 
283 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0730342  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  38.21 
 
 
285 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  34.93 
 
 
279 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  33.97 
 
 
279 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  33.57 
 
 
298 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  36.67 
 
 
280 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  33.94 
 
 
278 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  27.99 
 
 
277 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  33.49 
 
 
279 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  34.14 
 
 
283 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  33.49 
 
 
279 aa  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  30.4 
 
 
281 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  33.46 
 
 
300 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  32.08 
 
 
289 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  33.02 
 
 
278 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  35 
 
 
279 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  31.73 
 
 
283 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  32.05 
 
 
303 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  32.05 
 
 
293 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  33.49 
 
 
289 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  28.63 
 
 
275 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  34.85 
 
 
291 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  33.49 
 
 
289 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  28.63 
 
 
275 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  33.49 
 
 
289 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  35.1 
 
 
280 aa  100  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  33.99 
 
 
288 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  33.99 
 
 
288 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  36.53 
 
 
277 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  31.78 
 
 
292 aa  99.8  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  32.52 
 
 
311 aa  99.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  31.66 
 
 
283 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  33.49 
 
 
288 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  30.16 
 
 
300 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  25.59 
 
 
289 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  32.56 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  32.69 
 
 
300 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  31.01 
 
 
307 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  30.62 
 
 
308 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  37.62 
 
 
276 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  31.47 
 
 
290 aa  97.8  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  35.94 
 
 
282 aa  97.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  30.15 
 
 
307 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  37.26 
 
 
276 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  32.66 
 
 
283 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  34.91 
 
 
278 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  30.92 
 
 
278 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  28.79 
 
 
290 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  31.88 
 
 
282 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0944  hypothetical protein  26.29 
 
 
284 aa  94.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  31.14 
 
 
313 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  30.29 
 
 
287 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  35.16 
 
 
277 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  35 
 
 
277 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  24.91 
 
 
289 aa  93.2  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  33.18 
 
 
277 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  32.55 
 
 
316 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3962  hypothetical protein  32.32 
 
 
296 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.019618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  33.18 
 
 
277 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2688  hypothetical protein  32.1 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118004  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  29.73 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  31.2 
 
 
300 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  31.88 
 
 
278 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  33.65 
 
 
281 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  33.82 
 
 
277 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  32.86 
 
 
320 aa  90.5  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  33.64 
 
 
277 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>