17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1036 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  100 
 
 		 527 aa  1069    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  39.89 
 
 		 1149 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  38.79 
 
 		 293 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  32.67 
 
 		 830 aa  80.5  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  29.76 
 
 		 549 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  28.95 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  32.05 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 		 775 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  30 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4444  hypothetical protein  27.67 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  29.46 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  30.3 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  24.39 
 
 		 482 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  29.41 
 
 		 360 aa  47.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  28.57 
 
 		 553 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1784  hypothetical protein  22.53 
 
 		 370 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00387398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  24.24 
 
 		 398 aa  43.5  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>