22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0882 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
420 aa  797    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  75.2 
 
 
851 aa  530  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  47 
 
 
663 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  47.99 
 
 
663 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  58.18 
 
 
537 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  41.44 
 
 
648 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  45.09 
 
 
644 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  43.87 
 
 
645 aa  235  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  42.59 
 
 
638 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  42.36 
 
 
640 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  41.46 
 
 
378 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  38.34 
 
 
2055 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  47.56 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  42.13 
 
 
342 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  52.12 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  48.78 
 
 
715 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  33.98 
 
 
701 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  37.56 
 
 
602 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  41.43 
 
 
794 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  45.05 
 
 
744 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  60.53 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  34.96 
 
 
1793 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>