26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1732 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  100 
 
 
624 aa  1276    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  23.36 
 
 
551 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  29.71 
 
 
558 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  29.71 
 
 
552 aa  98.2  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  22.52 
 
 
509 aa  94  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  22.76 
 
 
551 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  27.62 
 
 
550 aa  91.3  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  26.27 
 
 
542 aa  90.1  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  22.07 
 
 
551 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  24.38 
 
 
551 aa  87  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  24.73 
 
 
552 aa  87  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  23.76 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  24.61 
 
 
547 aa  75.5  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  24.49 
 
 
586 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  23.93 
 
 
550 aa  71.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  22.03 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  20.72 
 
 
538 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  23.53 
 
 
517 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  22.28 
 
 
548 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  20.4 
 
 
509 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  23.39 
 
 
788 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  22.35 
 
 
492 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  23.66 
 
 
591 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  22.01 
 
 
553 aa  55.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  21.73 
 
 
545 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  24.18 
 
 
536 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>