22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0762 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0762  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 453 aa  929    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1897  putative Outer membrane protein  41.51 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  28.1 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  31.59 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  28.71 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3116  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 465 aa  163  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  27.95 
 
 		 469 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.25 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0879  Outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.175744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.44 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  24.6 
 
 		 481 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  27.94 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.96 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  24.27 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.36 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3688  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.47 
 
 		 511 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.595948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 471 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>