24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0274 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0274  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  173  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.744422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  43.59 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  44.59 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  41.56 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  50.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  44.12 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  44.78 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  44.26 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  43.06 
 
 
85 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  39.02 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  37.04 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  37.5 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3774  hypothetical protein  42.19 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.821745 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4050  hypothetical protein  42.19 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.497007  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  37.35 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  37.35 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1377  hypothetical protein  39.13 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  37.35 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  34.18 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  37.04 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  41.25 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  30.39 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  32.91 
 
 
122 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>