255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_R0002 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0047  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.644736  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.785646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1164  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.973303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.399437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1010  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2934  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0066  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1665  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0045  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0072  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0016  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.916543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0072  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1003  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0072  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0049  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0069  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0050  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.131977 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2351  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0040  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0063  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt34  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt42  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt34  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt42  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 92 bp  50.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0047  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.398541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0048  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.496608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0047  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_BR0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365312  normal  0.141763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0079  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0011  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0033  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0046  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0694  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.108922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0051  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000888669  normal  0.130057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0052  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000145228  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0053  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000187871  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0838  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.30479e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0020  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00905739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0042  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0267581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0029  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000950615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>