40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1646 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  45.26 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  31.64 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  33.66 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  31.14 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  30.4 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.33 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  33.49 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  29.45 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  32.39 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  27.64 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  28.1 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  27.73 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  32.34 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  32.34 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  27.87 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  27.24 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  26.41 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  31.55 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  31.31 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.89 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  30.1 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  31.07 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.78 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  25.63 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  26.7 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  30.65 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  27.23 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  26.46 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  26.83 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  27.97 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.67 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  29.66 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  27.46 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  23.26 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  24.63 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  23.26 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  32.2 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>