More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4548 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  100 
 
 
99 aa  189  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  71.72 
 
 
99 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  71.72 
 
 
99 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  71.72 
 
 
99 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13176  NADH dehydrogenase subunit K  74.49 
 
 
99 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1875  NADH dehydrogenase subunit K  70.71 
 
 
99 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4491  NADH dehydrogenase subunit K  69.7 
 
 
99 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  79.8 
 
 
99 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0548  NADH dehydrogenase subunit K  80.81 
 
 
99 aa  140  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.530448  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6672  NADH dehydrogenase subunit K  79.8 
 
 
99 aa  139  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1284  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  81.82 
 
 
99 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  77.78 
 
 
99 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4055  NADH dehydrogenase subunit K  85.11 
 
 
105 aa  138  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.7005  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4453  NADH dehydrogenase subunit K  85.11 
 
 
105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0291  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  79.17 
 
 
98 aa  135  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5063  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  78.79 
 
 
99 aa  135  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4408  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  77.78 
 
 
99 aa  135  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0392  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  76.53 
 
 
99 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6084  NADH dehydrogenase subunit K  77.78 
 
 
99 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0594  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  79.17 
 
 
98 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0530  NADH dehydrogenase subunit K  78.79 
 
 
99 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2685  NADH dehydrogenase subunit K  81.91 
 
 
96 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0903531  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0277  NADH dehydrogenase subunit K  76.77 
 
 
99 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  74.75 
 
 
99 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  66.33 
 
 
99 aa  130  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  77.55 
 
 
99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07480  NADH dehydrogenase subunit K  73.47 
 
 
99 aa  122  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0479  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  74.49 
 
 
99 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.4 
 
 
105 aa  118  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  60.61 
 
 
100 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  61.29 
 
 
100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.16 
 
 
100 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.08 
 
 
106 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.14 
 
 
100 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  58.16 
 
 
100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.08 
 
 
99 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0348  NADH dehydrogenase I, K subunit  59.79 
 
 
100 aa  105  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3345  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  57.73 
 
 
100 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.552125  normal  0.40692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.02 
 
 
103 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3219  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  69.39 
 
 
99 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.893545  normal  0.177018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.04 
 
 
109 aa  103  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.55 
 
 
114 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  49.48 
 
 
97 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.58 
 
 
101 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.67 
 
 
110 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3178  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  67.06 
 
 
99 aa  100  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0919  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  53.76 
 
 
100 aa  99.4  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.52 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3214  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  63.44 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1246  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.52 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0581596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  48.51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  48.51 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  52 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  47.52 
 
 
101 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0470  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  57.61 
 
 
118 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2388  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.04 
 
 
102 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00132006  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.48 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  53.19 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1867  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  47.31 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.937168  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4400  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.51 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2928  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  50.51 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.32 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1290  F420H2 dehydrogenase subunit K  47.96 
 
 
100 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  7.20191e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1299  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162862  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0402  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  55.43 
 
 
127 aa  88.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  45 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  55.17 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1273  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  54.84 
 
 
97 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.81 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.88 
 
 
101 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  44.44 
 
 
101 aa  87  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  44.44 
 
 
101 aa  87  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  50.53 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46.81 
 
 
101 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3404  F420H2 dehydrogenase subunit K  47.87 
 
 
100 aa  85.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143705  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1152  NADH dehydrogenase subunit K  41.41 
 
 
101 aa  85.9  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.75 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4136  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.49 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.48 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.83 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  44.44 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  51.58 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.33 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3216  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.48 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  49.47 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0959  NADH dehydrogenase subunit K  43.43 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158616  normal  0.425824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.92 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1628  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0373  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  53.06 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4623  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.48 
 
 
104 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0763865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  50.53 
 
 
104 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  50.53 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  50.53 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  50.53 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  50.53 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  50.53 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>